La unidad Huerquehue está ubicada en la Región de la Araucanía. La unidad destaca por la protección de las especies de fauna como el ratón topo valdiviano, el choroy, lagarto matuasto y ranita de Darwin. La fauna que vive en el área es muy variada, se pueden encontrar dos especies de zorros: chilla y culpeo, un pequeño mamífero marsupial llamado monito del monte, el pudú y el puma. Lo más fácil de observar es una gran variedad de aves que ocupan diferentes hábitats, entre las cuales destacan carpinteros, torcazas, abutardas y aguiluchos.

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